25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1597 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  308  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  62.35 
 
 
169 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  30.88 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  29.41 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  30.34 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  31.47 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  27.52 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  28.38 
 
 
187 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  31.3 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  30.57 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  33.68 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  31.91 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  29.13 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  31.91 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  27.03 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  31.51 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  31.51 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  28.08 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  26.85 
 
 
182 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  27.18 
 
 
187 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  29.21 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  25.52 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  25.64 
 
 
203 aa  40.8  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>