42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2522 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  99.43 
 
 		 174 aa  313  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.86 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  34.91 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  27.49 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  31.55 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  29.68 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  29.94 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  27.75 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  30.23 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  29.63 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  31.08 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  37.38 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  25.15 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.88 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  32.14 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  22.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  30.36 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  30.3 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  34.92 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  32.79 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  31.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0084  hypothetical protein  33.54 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105076  normal  0.179004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  25.3 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.89 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.31 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  31.51 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  33 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  33 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  33 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  26.04 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  40 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  32.96 
 
 		 203 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  26.79 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  32.96 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  31.9 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>