53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1436 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  407  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  31.9 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  32.02 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  22.65 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.68 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  27.72 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  26.07 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  27.84 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  28.05 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  26.88 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  26.92 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.98 
 
 
185 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  25.15 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  25.58 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  24.02 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  24.44 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  27.93 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  26.49 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  28.42 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  28.66 
 
 
176 aa  52  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  23.16 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  26.06 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  23.16 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  27.59 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  24.77 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  24.86 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  41 
 
 
176 aa  48.5  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  28.05 
 
 
244 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  24.75 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  20.3 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  27.97 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  24.19 
 
 
182 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  25.6 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  23.08 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  28.69 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  26.51 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  27.97 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  27.78 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  27.97 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  22.22 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  29.63 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  27.91 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  24.58 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  22.22 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  30.63 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  25.79 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  29.51 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  34.48 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  26.61 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  29.9 
 
 
194 aa  42  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  26.61 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  34.48 
 
 
189 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>