21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0940 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  100 
 
 		 192 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  59.28 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  41.3 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  36.7 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  41.57 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  36.81 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  36.02 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  36.42 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  36.42 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  35.8 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.02 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  25.84 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0950  hypothetical protein  28.21 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.42 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  28.82 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  24 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  35.09 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  25.79 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  24.28 
 
 		 185 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  32.41 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>