54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0585 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  59.28 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  40 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  37.1 
 
 		 197 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  38.8 
 
 		 195 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  38.04 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  36.11 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  35.4 
 
 		 193 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  35.4 
 
 		 193 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  35.4 
 
 		 193 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  33.96 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  31.76 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  33.91 
 
 		 196 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  30.51 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  29.82 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  28.25 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  29.55 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  26.07 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  27.72 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  26.63 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  25.81 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  25.53 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  25.53 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  29.14 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  26.63 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  24.16 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  27.81 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  26.49 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  24.84 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0950  hypothetical protein  28.03 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  27.04 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  27.61 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  25.81 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  27.65 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  24.63 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  24.06 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  26.98 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  26.9 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  27.37 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  25.29 
 
 		 177 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  27.68 
 
 		 184 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  31.48 
 
 		 189 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  26.29 
 
 		 417 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  24.27 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1559  hypothetical protein  30.99 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0136598  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  48.89 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  31.73 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  25.99 
 
 		 254 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>