15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0950 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0950  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  351  4e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  41.04 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  28.65 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  28.21 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  26.32 
 
 
214 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1909  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  54.7  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.294784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  23.6 
 
 
177 aa  48.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  24.28 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  24.14 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  32.94 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  32.94 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  32.94 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  28.24 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  27.65 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  25.58 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>