21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0343 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  41.57 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  38.55 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  35.71 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  38.04 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  35 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  37.43 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  36.36 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  36.36 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  36.36 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  29.45 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  28.1 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  25.99 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  27.96 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  26.63 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  24.69 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  30.25 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  28.18 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  32.11 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1594  hypothetical protein  26.57 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.27452  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2005  hypothetical protein  27.93 
 
 		 319 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0177268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>