61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4892 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  361  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  33.71 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  33.52 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  34.66 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  35.23 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  32.97 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  31.72 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  28.16 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.96 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  35.33 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  28.11 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  29.12 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  29.12 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  30.32 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  28.41 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  29.67 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  27.43 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  29.38 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  27.49 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  30.05 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  31.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  27.62 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  28.4 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  29.21 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  31.33 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  30.99 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  29.05 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  25.58 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  30.94 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  29.31 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  33.64 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  26.86 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  26.63 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  26.26 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  27.33 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.04 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  27.72 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  25.84 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  25.84 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  35.64 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  28.42 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  24.73 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  29.34 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  27.62 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  23.08 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  23.08 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  24.57 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  29.05 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  28.79 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.46 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  32.46 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  27.83 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>