24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1255 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  342  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  63.04 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  27.37 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  28.85 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  33.64 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  28.73 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  26.06 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  29.2 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.05 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  29.93 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  39.83 
 
 		 283 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  34.75 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  47.92 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  33.09 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  22.86 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  30.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  28.98 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2005  hypothetical protein  32.2 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  34.48 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  48.89 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  37.89 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  32.11 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>