43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5913 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  352  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  60.31 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  62.3 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  45.56 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  45.25 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  48.3 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  43.43 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  42.53 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  42.11 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  40.57 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  40.35 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  42.39 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  39.23 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  38.33 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  43.45 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  37.16 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  37.57 
 
 		 219 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  37.57 
 
 		 219 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  36.17 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  38.42 
 
 		 207 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  38.76 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  36.56 
 
 		 283 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  39.08 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  35.16 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  35.16 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  35.16 
 
 		 203 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  33.14 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.93 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  30.65 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  28.87 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  26.38 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.37 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  32.39 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  26.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  24.38 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  29.91 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  26.8 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  36.31 
 
 		 417 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>