88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4031 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  100 
 
 
196 aa  355  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  45.05 
 
 
254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  38.8 
 
 
190 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  36.63 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  32.24 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  32.24 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  32.16 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  31.72 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  30.77 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.02 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  35.63 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  36.36 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  32.07 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  33.14 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  29.65 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  32.07 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  32.78 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  33.92 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  33.91 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  32.14 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  29.17 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  35.43 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  35.39 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.72 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  29.57 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  31.03 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  32.94 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  35.38 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  32.95 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  30.61 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  32.02 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.61 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  32.94 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  30.39 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.61 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  29.71 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  29.63 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  32.31 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  32.31 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  32.47 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  32.94 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  34.2 
 
 
417 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  32.73 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  26.55 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  29.71 
 
 
186 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  28.74 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  29.08 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  29.05 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  29.31 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  31.01 
 
 
182 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  30.73 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  30.5 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  26.34 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  26.37 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  24.74 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  27.63 
 
 
187 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  28.4 
 
 
194 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2048  hypothetical protein  29.06 
 
 
164 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  31.61 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  25.79 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  34.12 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  28.18 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  27.43 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.24 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  30.46 
 
 
174 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  25.89 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  28.65 
 
 
185 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  29.89 
 
 
174 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  29.27 
 
 
196 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.69 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  29.75 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  23.73 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0582  hypothetical protein  28.49 
 
 
189 aa  44.7  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00912525  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  28.28 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  31.03 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  26.7 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  26.46 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0051  hypothetical protein  25.86 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  28.47 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  30.58 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1909  hypothetical protein  31.41 
 
 
326 aa  41.6  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.294784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  27.84 
 
 
170 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  27.84 
 
 
170 aa  41.6  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>