28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  815    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  52.2 
 
 
244 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  32 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  30.05 
 
 
194 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.77 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  32.77 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  34.39 
 
 
185 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  34.09 
 
 
196 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  33.91 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  33.02 
 
 
208 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  32.6 
 
 
208 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  36.97 
 
 
192 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  31.61 
 
 
182 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  36.21 
 
 
186 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  31.82 
 
 
190 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  26.39 
 
 
228 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  32.2 
 
 
219 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  25.81 
 
 
210 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  32.2 
 
 
219 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  30.73 
 
 
193 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  34.09 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  28.95 
 
 
184 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  33.54 
 
 
179 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  27.96 
 
 
186 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  33.52 
 
 
220 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  37.18 
 
 
190 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  35.54 
 
 
191 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>