44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1269 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  353  1e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  62.86 
 
 
177 aa  221  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  48.34 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  37.27 
 
 
184 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  34.85 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  37.06 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  25.87 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  25.37 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  25.37 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  31.11 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  27.75 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  27.33 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  30.65 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  26.79 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  30.81 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.63 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  29.89 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  29.89 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  28.27 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  26.63 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  29.48 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  29.89 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  27.27 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  32.48 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  27.38 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  28.73 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  24.06 
 
 
228 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  25.64 
 
 
215 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  31.51 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  29.95 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  25.15 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  25.44 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  30.4 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  28.96 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  27.72 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  25.27 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  25.42 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  30.57 
 
 
191 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  41.6  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  24.55 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  30.94 
 
 
203 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>