39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0749 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  328  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  62.96 
 
 
189 aa  167  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  40.99 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  36.42 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  34.72 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  35.09 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  31.38 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  32.28 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  29.83 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  25.67 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  25.67 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  29.38 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  22.28 
 
 
204 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  30.91 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  24.73 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  34.5 
 
 
191 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  27.43 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.53 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  37.82 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  28.49 
 
 
228 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.65 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  23.08 
 
 
203 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  28.83 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  23.08 
 
 
203 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  31.43 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  27.84 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.75 
 
 
210 aa  45.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  30.36 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  27.07 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  29.47 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  29.17 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  29.17 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0582  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  41.6  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00912525  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  26.11 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  27.12 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  26.19 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>