32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2203 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  333  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  63.04 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  28.95 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  26.74 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  28.42 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  31.72 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  26.92 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  31.82 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  26.49 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  26.24 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  30.59 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  28.82 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  28.27 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  25.7 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  35.64 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  32.28 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  24.57 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  31.55 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  28.24 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  48.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  30.88 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  26.29 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  28.8 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  28.78 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  27.65 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  48.84 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  27.34 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  46.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  24.55 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>