40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3584 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  100 
 
 
197 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  75.63 
 
 
197 aa  294  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  68.54 
 
 
195 aa  237  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  54.31 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  54.31 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  54.31 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  40.96 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  36.22 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  37.43 
 
 
214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  36.11 
 
 
228 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.74 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  27.62 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  31.1 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  28.57 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  24.86 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  26.14 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  25.12 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  27.12 
 
 
186 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32866  predicted protein  28.42 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  26.88 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  26.14 
 
 
182 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  31.72 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  37.18 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  29.19 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  36.9 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  30.6 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  30.56 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  31.64 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  30.6 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  23.46 
 
 
210 aa  42  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  28.49 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2048  hypothetical protein  34.43 
 
 
164 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  27.17 
 
 
190 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>