28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4412 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  353  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  33.16 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  39.37 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  29.41 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  32.16 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  30.06 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  37.23 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  37.23 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  37.23 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  31.1 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  32.35 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  36.14 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  32.58 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  30.99 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  32.05 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  28.72 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  34.11 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.2 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  32 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  28.07 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  32.12 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  25.86 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  26.25 
 
 		 185 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  29.86 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>