85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2796 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  71.57 
 
 		 192 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  71.57 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  62.05 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  57.95 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  58.82 
 
 		 193 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  43.32 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  35.4 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  33.15 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  30.73 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  32.76 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.82 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.13 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  29.5 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  35.5 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  22.65 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  24.04 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  29.28 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  31.48 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  26.7 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  28.98 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  27.69 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  26.09 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  27.6 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  31.55 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  26.09 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  27.37 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  27.37 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  26.14 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  25.29 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  31.47 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  28.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  26.86 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  27.91 
 
 		 457 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  25.29 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  21.93 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  23.33 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  25 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  25 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  25 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  30.08 
 
 		 175 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  28.82 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  29.2 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  38.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  28.43 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4217  HdeD protein  28.24 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  27.44 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  33.04 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32866  predicted protein  27.93 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  30.84 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  27.11 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  28.47 
 
 		 467 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  28.95 
 
 		 170 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  28.95 
 
 		 170 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.17 
 
 		 203 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.17 
 
 		 203 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  28.81 
 
 		 467 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  28.81 
 
 		 467 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  30.38 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  28.81 
 
 		 467 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  37.33 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  26.29 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0886  hypothetical protein  25.14 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.050947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  27.73 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.27 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  26.11 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  28.12 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>