44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0415 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  342  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  39.53 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  42.33 
 
 
185 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  39.29 
 
 
190 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  34.32 
 
 
187 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  35.5 
 
 
187 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  36.69 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  34.91 
 
 
255 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  32.57 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  33.14 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  32.16 
 
 
182 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  31.61 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  32.12 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  28.82 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  30.59 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  31.48 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  31.82 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  30.18 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  33.54 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  29.08 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  33.54 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  35.37 
 
 
202 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  25.58 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  28 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  25.86 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  24.64 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  26.29 
 
 
187 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  30.46 
 
 
182 aa  51.2  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  26.9 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  27.98 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  25.34 
 
 
189 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  24.42 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  27.78 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  31.21 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  29.23 
 
 
208 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  20.23 
 
 
192 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  29.76 
 
 
203 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>