37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0797 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  380  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  35.23 
 
 
196 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  32.62 
 
 
187 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  31.91 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  32.8 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  35.67 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  31.61 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  31.58 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  31.21 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  27.71 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  30.64 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  27.71 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  29.03 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3512  hypothetical protein  64.2 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  26.26 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  33.13 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  23.53 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  25.53 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  34.3 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.68 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  30.97 
 
 
185 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  27.66 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  26.19 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  23.21 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  36.21 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  29.35 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  27.14 
 
 
191 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  29.05 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  32.04 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  26.92 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  28.87 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  27.54 
 
 
205 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  29.17 
 
 
174 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>