40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0350 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  363  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  37.95 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  37.2 
 
 
187 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  33.69 
 
 
187 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  32.92 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  32.72 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  29.57 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  28.88 
 
 
255 aa  85.1  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  29.7 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  32.74 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  33.11 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  32.5 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  32.82 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  37.82 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  37.82 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  28.48 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  29.22 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  33.09 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  27.62 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  34.68 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  26.09 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  28.75 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  23.7 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  28.31 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.26 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  23.66 
 
 
185 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  32.54 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  25.32 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  28.3 
 
 
181 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  26.34 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  24.82 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  27.15 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  26.62 
 
 
452 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  28.92 
 
 
208 aa  41.2  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>