19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4145 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  100 
 
 
452 aa  900    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2126  membrane-bound protease  39.19 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.452809  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0317  hypothetical protein  40.92 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  42.35 
 
 
440 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  40.65 
 
 
467 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  40.65 
 
 
467 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  40.65 
 
 
467 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  40.65 
 
 
467 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  40.19 
 
 
467 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0720  hypothetical protein  40.82 
 
 
465 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4891  hypothetical protein  40.19 
 
 
467 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3666  hypothetical protein  40.42 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.927067  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3282  hypothetical protein  39.22 
 
 
475 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866532  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  39.12 
 
 
457 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1263  hypothetical protein  39.29 
 
 
469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000260346  normal  0.656156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1668  hypothetical protein  38.81 
 
 
473 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  hitchhiker  0.00555235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  31.33 
 
 
196 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  33.86 
 
 
192 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  32 
 
 
191 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>