16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4891 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  92.51 
 
 		 467 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  94.22 
 
 		 467 aa  900    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  99.36 
 
 		 467 aa  936    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  94.22 
 
 		 467 aa  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3666  hypothetical protein  90.79 
 
 		 467 aa  864    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.927067  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  74.38 
 
 		 457 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  94.43 
 
 		 467 aa  902    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4891  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  942    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0720  hypothetical protein  66 
 
 		 465 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3282  hypothetical protein  68.12 
 
 		 475 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1263  hypothetical protein  66.59 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000260346  normal  0.656156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  66.08 
 
 		 440 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0317  hypothetical protein  62.19 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  40.19 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1668  hypothetical protein  40.52 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  hitchhiker  0.00555235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2126  membrane-bound protease  36.05 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.452809  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>