16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1263 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3282  hypothetical protein  91.58 
 
 
475 aa  837    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866532  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1263  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  945    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000260346  normal  0.656156 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0720  hypothetical protein  67.69 
 
 
465 aa  621  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3666  hypothetical protein  65.89 
 
 
467 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.927067  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  69.96 
 
 
440 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  66.81 
 
 
467 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4891  hypothetical protein  67.04 
 
 
467 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  65.47 
 
 
467 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  66.37 
 
 
467 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  66.37 
 
 
467 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  66.37 
 
 
467 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0317  hypothetical protein  62.67 
 
 
467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  64.69 
 
 
457 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1668  hypothetical protein  42.76 
 
 
473 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  hitchhiker  0.00555235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  39.51 
 
 
452 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2126  membrane-bound protease  35.8 
 
 
428 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.452809  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>