16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2126 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2126  membrane-bound protease  100 
 
 
428 aa  864    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.452809  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  39.19 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  36.67 
 
 
467 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  36.36 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  36.36 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  36.36 
 
 
467 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3666  hypothetical protein  36.67 
 
 
467 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.927067  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4891  hypothetical protein  36.05 
 
 
467 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100909 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0317  hypothetical protein  37.38 
 
 
467 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0720  hypothetical protein  37.18 
 
 
465 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3282  hypothetical protein  38.04 
 
 
475 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866532  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  36.83 
 
 
440 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1263  hypothetical protein  34.7 
 
 
469 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000260346  normal  0.656156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  34.74 
 
 
467 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  34.13 
 
 
457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1668  hypothetical protein  37 
 
 
473 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  hitchhiker  0.00555235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>