19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5387 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3282  hypothetical protein  71.36 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1263  hypothetical protein  69.96 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000260346  normal  0.656156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  65.85 
 
 		 467 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4891  hypothetical protein  66.08 
 
 		 467 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  65.85 
 
 		 467 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  66.08 
 
 		 467 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  65.85 
 
 		 467 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3666  hypothetical protein  65.63 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.927067  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  65.63 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0317  hypothetical protein  64.98 
 
 		 467 aa  559  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0720  hypothetical protein  63.22 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  65.38 
 
 		 457 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  42.35 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1668  hypothetical protein  44.29 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  hitchhiker  0.00555235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2126  membrane-bound protease  37.85 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.452809  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  26.14 
 
 		 190 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  30.84 
 
 		 191 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>