20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4460 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  74.73 
 
 
467 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5336  hypothetical protein  74.95 
 
 
467 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  919    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3666  hypothetical protein  73.41 
 
 
467 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.927067  normal  0.797605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4950  hypothetical protein  74.95 
 
 
467 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3418  hypothetical protein  74.95 
 
 
467 aa  705    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4891  hypothetical protein  74.73 
 
 
467 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0731  hypothetical protein  74.29 
 
 
467 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126017  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3282  hypothetical protein  65.95 
 
 
475 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866532  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0720  hypothetical protein  61.59 
 
 
465 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1263  hypothetical protein  65.04 
 
 
469 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000260346  normal  0.656156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5387  hypothetical protein  66.05 
 
 
440 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0317  hypothetical protein  58.31 
 
 
467 aa  508  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1668  hypothetical protein  43.13 
 
 
473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440084  hitchhiker  0.00555235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  38.32 
 
 
452 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2126  membrane-bound protease  34.55 
 
 
428 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.452809  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.75 
 
 
196 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  28.26 
 
 
191 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.4 
 
 
192 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  26.19 
 
 
190 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>