28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3859 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  100 
 
 		 189 aa  366  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  59.79 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  59.79 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  59.79 
 
 		 189 aa  231  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  48.94 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  49.72 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  31.22 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  32.04 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  26.84 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  25.84 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  29.66 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  24.04 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  23.91 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  25.71 
 
 		 174 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  25.71 
 
 		 174 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  26.71 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  25.13 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  23.4 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  26.47 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>