33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1798 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  29.12 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  24.59 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  28.4 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  26.46 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  28.21 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.37 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  25.26 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  26.95 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  26.56 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  25.29 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.61 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  29.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  31.63 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  22.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  27.5 
 
 		 255 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.28 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  31.13 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  24.53 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  27.74 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  23.7 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  23.65 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>