12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4217 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4217  HdeD protein  100 
 
 		 210 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.84 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  27.68 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  24.56 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  27.81 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  26.62 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.75 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.41 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  31.3 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  30.16 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>