29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0084 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  329  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105076  normal  0.179004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  33.54 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  33.54 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  30.63 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  27.98 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.72 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  27.44 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  23.86 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  36.2 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  29.81 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  29.81 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  27.04 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  27.33 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  27.95 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  27.5 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  27.44 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  27.44 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  27.44 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.74 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  27.04 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  27.21 
 
 		 191 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  26.83 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  30.41 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  26.67 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  27.17 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  25.17 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>