34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2336 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2048  hypothetical protein  92.07 
 
 		 164 aa  236  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.43 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  26.71 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  24.05 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  27.22 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  24.38 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.63 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  25.6 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  29.32 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  30.19 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  25.33 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  30.19 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  25.6 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  26.25 
 
 		 207 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  29.75 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  30.84 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  26.62 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  26.79 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  23.57 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  28.83 
 
 		 169 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  28.44 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  26.75 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  25 
 
 		 197 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  23.75 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  24.85 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  23.75 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  29.41 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  25.45 
 
 		 254 aa  41.2  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>