18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  336  9e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  36.81 
 
 
175 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0051  hypothetical protein  37.87 
 
 
176 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  28.07 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  31.98 
 
 
283 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  28.57 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  30.91 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  27.27 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  29.09 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  29.09 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  29.09 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  31.29 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  26.95 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  26.01 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  30.47 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  30.56 
 
 
192 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.59 
 
 
228 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>