More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12463 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12463  ribokinase rbsK  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  63.32 
 
 		 285 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  62.98 
 
 		 285 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  62.98 
 
 		 285 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3935  ribokinase  60.27 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2643  ribokinase  60.68 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  46.06 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  39.53 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  40.52 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.86 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.23 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  37.38 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  40.96 
 
 		 296 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  43.34 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.22 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  43.36 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  37.99 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  46.06 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.16 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.55 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  37.16 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  34.42 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  39.15 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  42.19 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  39.54 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  35.48 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.81 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  32.8 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  37.31 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  32.23 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  45.28 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  36.43 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  38.55 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  35.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  33.76 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  37.66 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  36.96 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  35.84 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  36.77 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  36.15 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  36.49 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  39.46 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  42.64 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  35.84 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  36.52 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  35.84 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  32.23 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  36.3 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1176  PfkB domain protein  42.29 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.156952  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  33.68 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  35.49 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  37.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  33.96 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  35.15 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  34.81 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  28.48 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  29.21 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  33 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  37.69 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.92 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  36.26 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.55 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  36.76 
 
 		 327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  43.33 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  31.44 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  35.94 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  38.95 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  33.86 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  36.88 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  37.4 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  35.58 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  33.99 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  38.74 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  39.06 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  29.87 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.58 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  35.22 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  36.26 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  41.57 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  34.46 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  33.66 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  38.01 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  36.26 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.07 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  40.17 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  37.42 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  35.79 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  36.72 
 
 		 321 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  35.66 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  33.54 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.85 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  28.71 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  37 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  31.56 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  35.38 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1193  PfkB domain protein  35.5 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.8184  normal  0.176819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.46 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>