More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3935 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3935  ribokinase  100 
 
 		 286 aa  550  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2643  ribokinase  77.54 
 
 		 286 aa  363  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  65.51 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  65.51 
 
 		 285 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  65.51 
 
 		 285 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12463  ribokinase rbsK  61.48 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  39.81 
 
 		 313 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  43.58 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.13 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.88 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  46.67 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  40.46 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  38.33 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  40.96 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  41.06 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.75 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  42.91 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  44.61 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.58 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.88 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  38.51 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  43.3 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  32.84 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  34.65 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  32.15 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  37.46 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  39.74 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  35.69 
 
 		 305 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  37.04 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  41.92 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.18 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  39.87 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  39.87 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  39.87 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.93 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.58 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.48 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  40 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  43.58 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  38.85 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  37.75 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.13 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.41 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.03 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  38.33 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  43.24 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  32.44 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.93 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  42.41 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  45.42 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  31.95 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  39.39 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  37.31 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  32.89 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  40.64 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2130  ribokinase-like domain-containing protein  39.54 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  37.76 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.67 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  36.61 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  35.76 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  35.17 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  36.91 
 
 		 302 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  29.47 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  37.76 
 
 		 315 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  38.91 
 
 		 320 aa  137  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  38.78 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  40.68 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.58 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  38.89 
 
 		 326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  39.7 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  38.93 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1176  PfkB domain protein  41.37 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.156952  normal  0.0586997 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  36.19 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  39 
 
 		 315 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  34.43 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  39 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  38.22 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  37.36 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  33.66 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  36.56 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.98 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  33.98 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.98 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  34.23 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  37.64 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  32.33 
 
 		 403 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  35.14 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  35.05 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  34.75 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  31.46 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  32.9 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  34.48 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>