More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0652 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  42.09 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  38.54 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  41.61 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  39.07 
 
 		 313 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  37.41 
 
 		 307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.68 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  38.49 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  37.46 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  39.06 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  35.15 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.76 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  39.39 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.13 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.97 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  37.92 
 
 		 321 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.38 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  36.82 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  44.87 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  44.87 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  44.87 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  35.86 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.73 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.54 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40.56 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  36.81 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  33.91 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.37 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.24 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  40.21 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  37.93 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  38.33 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.29 
 
 		 345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  42.75 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37.85 
 
 		 308 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  36.55 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  37.12 
 
 		 311 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  39.42 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  37.12 
 
 		 311 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  40.21 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  36.11 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  45.94 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37.85 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  37.58 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  31.69 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  34.84 
 
 		 403 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.02 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.24 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  41.67 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.16 
 
 		 297 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.22 
 
 		 340 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  33.91 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1705  ribokinase  43.4 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  36.79 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  36.77 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  41.73 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  41.61 
 
 		 320 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  35.52 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.07 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.46 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  38.81 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  32.99 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  38.35 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  45.9 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  35.76 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  38.46 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  41.13 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  36.36 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  39.51 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  34.39 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  36.93 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  39.52 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.63 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  37.07 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.63 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.63 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  36.59 
 
 		 314 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  38.33 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  36.97 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  36.43 
 
 		 424 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  39.39 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  36.49 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.99 
 
 		 398 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  39.39 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.37 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.02 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  35.62 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  39.23 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  38.19 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  32.29 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  32.29 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  36.62 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>