More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2643 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2643  ribokinase  100 
 
 		 286 aa  547  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3935  ribokinase  77.54 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  67.48 
 
 		 285 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  67.48 
 
 		 285 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  67.48 
 
 		 285 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12463  ribokinase rbsK  61.7 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42.8 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  39.3 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  42.24 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  36.27 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  44.03 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  34.47 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1559  PfkB domain protein  45.04 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  34.09 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  38.78 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.86 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  37.76 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  39.09 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  43.15 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  39.07 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  33.98 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  39.09 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  40.2 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  38.06 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.02 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.58 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  41.54 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  37.04 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  39.68 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  37.72 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  41.28 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.28 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  44.37 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.14 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  36 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  36 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  36 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  37.17 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  30.1 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  38.26 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1202  ribokinase-like domain-containing protein  43.8 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.744137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  42.19 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  35.22 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  37.84 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  41.55 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  40.82 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  38.74 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  37.94 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  31.05 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  37.31 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  35.69 
 
 		 318 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  46.5 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  37.34 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.84 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  33.8 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  41.18 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  39.23 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  40.53 
 
 		 349 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  39.19 
 
 		 326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  34.98 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  34.88 
 
 		 307 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  33.22 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  34.33 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2130  ribokinase-like domain-containing protein  39.02 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  39.67 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  39.67 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.11 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  39.47 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  41.39 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  39.39 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  35.35 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  36.88 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  36.88 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  39.46 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  36.88 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  36.67 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  37.78 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  35.71 
 
 		 319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  36.88 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  37.37 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  43.98 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  33.89 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  33.89 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  33.89 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  37.84 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  33.89 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  33.89 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>