More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2515 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_4314  UvrD/REP helicase  49.61 
 
 		 785 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2515  putative DNA helicase  100 
 
 		 755 aa  1504    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4965  UvrD/REP helicase  45.71 
 
 		 781 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4621  UvrD/REP helicase  49.15 
 
 		 776 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2810  UvrD/REP helicase  45.29 
 
 		 783 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3290  UvrD/REP helicase  45.29 
 
 		 783 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.353661  normal  0.284244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2533  UvrD/REP helicase  43.39 
 
 		 808 aa  597  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313169  normal  0.108107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1425  UvrD/REP helicase  46.65 
 
 		 833 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3948  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 748 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0206  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 743 aa  190  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.83 
 
 		 690 aa  88.6  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.22 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  25.35 
 
 		 646 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.49 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.69 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.75 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  23.72 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.2 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.2 
 
 		 787 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.5 
 
 		 776 aa  73.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  22.74 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  24.28 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.6 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  21.86 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.48 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.57 
 
 		 743 aa  72.8  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 665 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 663 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.47 
 
 		 794 aa  71.6  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.88 
 
 		 755 aa  71.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0681  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.46 
 
 		 1230 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.639627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.24 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 659 aa  70.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.33 
 
 		 674 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 673 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 674 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0777  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.09 
 
 		 1230 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.03 
 
 		 675 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.62 
 
 		 796 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  26.44 
 
 		 1181 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0092  ATP-dependent DNA helicase rep  25.6 
 
 		 671 aa  68.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.157816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.51 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.55 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  27.16 
 
 		 1181 aa  69.3  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  26.96 
 
 		 1181 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.15 
 
 		 694 aa  68.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.78 
 
 		 670 aa  68.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  26.96 
 
 		 1181 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.88 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.72 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.15 
 
 		 674 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.56 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.4 
 
 		 715 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  26.96 
 
 		 1181 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  21.22 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  24.66 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 1134 aa  67.4  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.79 
 
 		 725 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03301  UvrD/REP helicase  24.3 
 
 		 809 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.479147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.07 
 
 		 1229 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  26.74 
 
 		 1244 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.16 
 
 		 785 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.69 
 
 		 737 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.18 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.96 
 
 		 671 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  22.82 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  20.52 
 
 		 735 aa  66.2  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.27 
 
 		 833 aa  66.6  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  22.93 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.35 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.35 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  22.19 
 
 		 672 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0681  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.51 
 
 		 1208 aa  66.6  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  22.6 
 
 		 858 aa  65.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.35 
 
 		 673 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 787 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03301  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  24.9 
 
 		 1212 aa  65.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  22.03 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.24 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 807 aa  65.1  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 659 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>