More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3290 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4965  UvrD/REP helicase  71.91 
 
 		 781 aa  1139    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2810  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 783 aa  1612    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1425  UvrD/REP helicase  54.92 
 
 		 833 aa  849    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3290  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 783 aa  1612    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.353661  normal  0.284244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2533  UvrD/REP helicase  51.5 
 
 		 808 aa  797    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313169  normal  0.108107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4314  UvrD/REP helicase  55.95 
 
 		 785 aa  847    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4621  UvrD/REP helicase  55.58 
 
 		 776 aa  793    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2515  putative DNA helicase  45.57 
 
 		 755 aa  588  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.587637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0206  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3948  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 748 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.98 
 
 		 781 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.83 
 
 		 781 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.34 
 
 		 715 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.77 
 
 		 785 aa  88.6  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.06 
 
 		 673 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  21.48 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.76 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  21.43 
 
 		 678 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.25 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  22.14 
 
 		 678 aa  82  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  21.85 
 
 		 678 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.76 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  21.82 
 
 		 731 aa  81.3  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 1134 aa  80.9  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.76 
 
 		 738 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.14 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 738 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.42 
 
 		 751 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.42 
 
 		 751 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  20.42 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  20.42 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.42 
 
 		 751 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.47 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.95 
 
 		 747 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 738 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.47 
 
 		 747 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.29 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  22 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  22.02 
 
 		 742 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0968  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.21 
 
 		 805 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  22.21 
 
 		 805 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.95 
 
 		 772 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.61 
 
 		 794 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  22.39 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  21.67 
 
 		 770 aa  76.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0127  DNA helicase II  21.6 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.889231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 1132 aa  75.1  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.24 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.85 
 
 		 674 aa  74.7  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  22.09 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  21.7 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 807 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  24.06 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.03 
 
 		 732 aa  73.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  21.59 
 
 		 737 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.37 
 
 		 757 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  23.78 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  23.78 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0428  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.06 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.48 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 1124 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  22.31 
 
 		 900 aa  72  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 666 aa  72  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  22.09 
 
 		 736 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.18 
 
 		 671 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.74 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.84 
 
 		 743 aa  71.2  0.00000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  24.46 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  20.86 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  20.15 
 
 		 735 aa  71.2  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.7 
 
 		 725 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  24.18 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 759 aa  70.5  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 		 1161 aa  70.5  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002685  exodeoxyribonuclease V beta chain  24.3 
 
 		 1224 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.58 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  21.65 
 
 		 726 aa  68.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  21.07 
 
 		 729 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  22.58 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0689  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.61 
 
 		 1229 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0221198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.22 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03371  UvrD/REP helicase  21.81 
 
 		 802 aa  67.8  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  21.81 
 
 		 669 aa  67.4  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  21.47 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  21.47 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.23 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  21 
 
 		 1066 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 1019 aa  67.4  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.84 
 
 		 781 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2115  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 616 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00449221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  21.47 
 
 		 728 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.09 
 
 		 1023 aa  67.4  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  25.34 
 
 		 816 aa  67  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.66 
 
 		 706 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  24.93 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>