More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
384 aa  798    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.77 
 
 
404 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.51 
 
 
399 aa  524  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  66.15 
 
 
399 aa  523  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.99 
 
 
384 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.99 
 
 
384 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.94 
 
 
382 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.99 
 
 
384 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.88 
 
 
383 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  59.84 
 
 
382 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  60.77 
 
 
418 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  61.68 
 
 
384 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.05 
 
 
383 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.1 
 
 
384 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  58.87 
 
 
417 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  58.61 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  54.43 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.57 
 
 
382 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  46.43 
 
 
395 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.59 
 
 
398 aa  348  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  44.39 
 
 
388 aa  338  7e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  45.78 
 
 
406 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  48.42 
 
 
384 aa  335  7e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  45.64 
 
 
401 aa  332  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.08 
 
 
404 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.56 
 
 
404 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  45.08 
 
 
404 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.27 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.7 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  45.08 
 
 
456 aa  326  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  46.94 
 
 
391 aa  325  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 
406 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  43.81 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.1 
 
 
406 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 
406 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  44.44 
 
 
386 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  44.13 
 
 
397 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  44.13 
 
 
397 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.62 
 
 
397 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  43.7 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  43.37 
 
 
398 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.62 
 
 
398 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.44 
 
 
398 aa  308  8e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.09 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.09 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.09 
 
 
397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.35 
 
 
397 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.74 
 
 
389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  45.27 
 
 
361 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  45.27 
 
 
361 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 
392 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  45.27 
 
 
361 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
390 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  40.52 
 
 
392 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.63 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  23.1 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.23 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
318 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 
334 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3907  UDP-glucose 4-epimerase  32 
 
 
336 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.179551 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  25.99 
 
 
325 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  25.23 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  24.56 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  31.79 
 
 
336 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  30.46 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.36 
 
 
285 aa  60.1  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  28.48 
 
 
339 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
309 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
367 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0789  UDP-galactose 4-epimerase  28.98 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  35.43 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.14 
 
 
320 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  34.09 
 
 
338 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  24.01 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  31.13 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  27.81 
 
 
337 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3965  UDP-glucose 4-epimerase  28.41 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  31.13 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.24 
 
 
680 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  31.13 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  30.87 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>