More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0639 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
384 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.5 
 
 
384 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.38 
 
 
384 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  87.5 
 
 
384 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.84 
 
 
383 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
384 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.39 
 
 
383 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  83.51 
 
 
418 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.06 
 
 
382 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.71 
 
 
404 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.97 
 
 
399 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  66.14 
 
 
390 aa  552  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  67.45 
 
 
399 aa  551  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  62.99 
 
 
384 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  61.78 
 
 
382 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  59.9 
 
 
418 aa  484  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  59.9 
 
 
417 aa  487  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 
382 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  44.99 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 
401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  43.37 
 
 
395 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  44.94 
 
 
384 aa  349  4e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  46.27 
 
 
401 aa  341  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  45.15 
 
 
406 aa  339  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  45.92 
 
 
386 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  46.04 
 
 
391 aa  335  9e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 
406 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  45.74 
 
 
456 aa  333  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  44.9 
 
 
406 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
398 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.56 
 
 
406 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.33 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  43.33 
 
 
404 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 
406 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.15 
 
 
406 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  43.91 
 
 
402 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.51 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  43.99 
 
 
398 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.48 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.22 
 
 
397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.22 
 
 
398 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.48 
 
 
397 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.22 
 
 
397 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.73 
 
 
397 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.98 
 
 
397 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.73 
 
 
397 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  44.89 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  44.6 
 
 
361 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  44.6 
 
 
361 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
389 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 
392 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.95 
 
 
390 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  35.75 
 
 
392 aa  249  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.51 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.04 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  25.68 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  26.44 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 
308 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.55 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
328 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
314 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.81 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.49 
 
 
354 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  25.18 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
306 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 
292 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1559  UDP-glucose 4-epimerase  31.43 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0142095  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.91 
 
 
353 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
322 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0707  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.09 
 
 
339 aa  59.7  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0585358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  31.68 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  30.88 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  32.08 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  23.68 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>