More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1227 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  85.38 
 
 
392 aa  695    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
390 aa  800    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.85 
 
 
382 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 
392 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 
399 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
382 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  41.25 
 
 
399 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  40.36 
 
 
384 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
384 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 
384 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 
384 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  36.62 
 
 
388 aa  253  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  37.34 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  38.44 
 
 
384 aa  252  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.48 
 
 
383 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  37.82 
 
 
382 aa  249  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 
384 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  36.21 
 
 
418 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  36.5 
 
 
417 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
383 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  36.5 
 
 
418 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  38.46 
 
 
384 aa  229  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.23 
 
 
389 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
406 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  36.29 
 
 
406 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  37.36 
 
 
395 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.76 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  35.73 
 
 
401 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.68 
 
 
397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.68 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.13 
 
 
398 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.68 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.68 
 
 
397 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  35.64 
 
 
398 aa  212  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.06 
 
 
397 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.41 
 
 
397 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.38 
 
 
398 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
404 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  34.96 
 
 
386 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 
404 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  35.5 
 
 
406 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  34.54 
 
 
404 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  35.75 
 
 
402 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.01 
 
 
406 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 
401 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  35.9 
 
 
391 aa  202  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.12 
 
 
398 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
406 aa  199  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  34.99 
 
 
456 aa  196  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  34.2 
 
 
361 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  34.2 
 
 
361 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  34.48 
 
 
361 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
285 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.92 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.49 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  25 
 
 
336 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.02 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.33 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.77 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2900  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  23.64 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.83 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.3 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  27.05 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  25.68 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.3 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.83 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.3 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.92 
 
 
357 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
324 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  24.31 
 
 
359 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0486  UDP-glucose 4-epimerase  29.63 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00171475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.22 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  23.33 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.53 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  26.39 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.94 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.53 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  26.88 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 
324 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>