More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0293 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.8 
 
 
384 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.98 
 
 
383 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
384 aa  799    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.5 
 
 
384 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.99 
 
 
383 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.43 
 
 
384 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  83.51 
 
 
418 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  87.5 
 
 
384 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.23 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.72 
 
 
382 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.71 
 
 
404 aa  558  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  68.24 
 
 
399 aa  548  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  64.57 
 
 
390 aa  542  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  60.1 
 
 
382 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  61.68 
 
 
384 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  59.01 
 
 
417 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  59.01 
 
 
418 aa  475  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.48 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  44.04 
 
 
388 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  43.62 
 
 
395 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.79 
 
 
401 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  44.9 
 
 
406 aa  332  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  45.24 
 
 
401 aa  329  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  46.41 
 
 
386 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  43.49 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.9 
 
 
406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  44.78 
 
 
406 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  44.96 
 
 
456 aa  322  5e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  45.64 
 
 
391 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.29 
 
 
406 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.36 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
404 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  43.99 
 
 
404 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.45 
 
 
406 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.78 
 
 
406 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  44.76 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.65 
 
 
398 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  44.16 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  44.76 
 
 
397 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.48 
 
 
397 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  44.25 
 
 
398 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.22 
 
 
397 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.26 
 
 
397 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.73 
 
 
397 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.26 
 
 
397 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43 
 
 
397 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  44.89 
 
 
361 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  44.6 
 
 
361 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  44.6 
 
 
361 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
392 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  36.01 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
382 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.5 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
333 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  29.07 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  29.27 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  28.62 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  28.31 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  28.14 
 
 
337 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  28.57 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  33.09 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.86 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
310 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.07 
 
 
298 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  32.45 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.07 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.1 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  28.32 
 
 
337 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1433  UDP-glucose 4-epimerase  27.53 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0122713  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  26.47 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.91 
 
 
311 aa  60.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
354 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  32.45 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
331 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.5 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.29 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
331 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.96 
 
 
319 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1713  UDP-glucose 4-epimerase  30.95 
 
 
338 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0170656  normal  0.546572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.44 
 
 
367 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
325 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.16 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.61 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>