More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0398 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.51 
 
 
384 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  83.51 
 
 
384 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.03 
 
 
384 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.51 
 
 
384 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.02 
 
 
384 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
418 aa  872    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.57 
 
 
383 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.72 
 
 
383 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.32 
 
 
382 aa  558  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.69 
 
 
404 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.69 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  63.48 
 
 
399 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  60.82 
 
 
390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  60.77 
 
 
384 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  59.33 
 
 
382 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  54.65 
 
 
417 aa  475  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  54.59 
 
 
418 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.03 
 
 
382 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  42.39 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.43 
 
 
401 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  40.55 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  45 
 
 
391 aa  334  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  43.49 
 
 
406 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  44.05 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  43.24 
 
 
456 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.5 
 
 
398 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  42.42 
 
 
384 aa  325  7e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.43 
 
 
406 aa  320  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.22 
 
 
404 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  45.2 
 
 
386 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  41.94 
 
 
404 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
404 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  43.63 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  42.82 
 
 
406 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.07 
 
 
398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 
406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.86 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.33 
 
 
397 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.65 
 
 
398 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.71 
 
 
406 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.93 
 
 
397 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  41.61 
 
 
402 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.13 
 
 
397 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.83 
 
 
397 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.13 
 
 
397 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40.39 
 
 
397 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.95 
 
 
397 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  42.55 
 
 
361 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  42.55 
 
 
361 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  42.28 
 
 
361 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
390 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  34.53 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
392 aa  230  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.57 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 
340 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.85 
 
 
328 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  24.55 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  25.73 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0260  UDP-glucose 4-epimerase  30.15 
 
 
353 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.115261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
306 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
309 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1236  UDP-galactose 4-epimerase  30.37 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3183  UDP-glucose 4-epimerase  25.15 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.670308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  25.44 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  30.57 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  25.44 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.17 
 
 
298 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  25.15 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.27 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0182  UDP-glucose 4-epimerase  28.28 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  23.91 
 
 
321 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  23.22 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  23.22 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
337 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
331 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  27.54 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.49 
 
 
310 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
337 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  25.3 
 
 
337 aa  56.6  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  29.56 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1477  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
337 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000121809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  29.33 
 
 
337 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1446  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000042923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.14 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1327  UDP-glucose 4-epimerase  26.05 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  23.48 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  25.81 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  24.73 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.17 
 
 
310 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  26.01 
 
 
336 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>