More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1240 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
399 aa  822    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.59 
 
 
382 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.11 
 
 
384 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.67 
 
 
383 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.02 
 
 
399 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  68.24 
 
 
384 aa  548  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.45 
 
 
384 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.75 
 
 
404 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.45 
 
 
384 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.49 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  64.66 
 
 
382 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  66.15 
 
 
384 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  63.48 
 
 
418 aa  535  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.93 
 
 
384 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  61.68 
 
 
390 aa  525  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  57.55 
 
 
418 aa  472  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  57.81 
 
 
417 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.61 
 
 
382 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  48.21 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.11 
 
 
401 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51 
 
 
398 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  45.62 
 
 
388 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  47.91 
 
 
401 aa  364  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.69 
 
 
404 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  47.87 
 
 
456 aa  359  4e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.72 
 
 
406 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  46.63 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  46.75 
 
 
384 aa  355  7.999999999999999e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.91 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  47.91 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  48.7 
 
 
406 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  48.61 
 
 
398 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  48.17 
 
 
402 aa  351  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.72 
 
 
406 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.69 
 
 
406 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  48.08 
 
 
398 aa  346  3e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  49.24 
 
 
391 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  47.59 
 
 
398 aa  342  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  48.34 
 
 
386 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  46.08 
 
 
397 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  46.08 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  46.8 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  44.76 
 
 
397 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  45.57 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  45.01 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  45.01 
 
 
397 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.9 
 
 
389 aa  327  3e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  47.8 
 
 
361 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  47.8 
 
 
361 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  47.53 
 
 
361 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 
392 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
390 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  38.67 
 
 
392 aa  261  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
382 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.15 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  38.67 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.25 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0367  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0019063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  37.01 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2644  UDP-glucose 4-epimerase  31.25 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1059  UDP-glucose 4-epimerase  34.16 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0878912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
352 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  27.67 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.14 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  26.65 
 
 
328 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0707  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.73 
 
 
339 aa  64.7  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0585358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2530  UDP-glucose 4-epimerase  36.22 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000741336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.26 
 
 
358 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  32.45 
 
 
335 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
310 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
310 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
367 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
335 aa  62.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1081  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.72 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
310 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.78 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
335 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  23.97 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.43 
 
 
325 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1664  UDP-glucose 4-epimerase  26.6 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  27.44 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>