More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21351 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  99.75 
 
 
397 aa  825    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  87.31 
 
 
398 aa  741    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  87.56 
 
 
398 aa  744    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  88.58 
 
 
397 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  74.37 
 
 
402 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  88.41 
 
 
397 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  88.32 
 
 
397 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  88.32 
 
 
397 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  89.34 
 
 
397 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  100 
 
 
397 aa  827    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  88.58 
 
 
398 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  69.43 
 
 
386 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  66.92 
 
 
406 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  65.9 
 
 
401 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  65.66 
 
 
406 aa  541  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.97 
 
 
406 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.99 
 
 
404 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  65.74 
 
 
404 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  65.03 
 
 
391 aa  531  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.2 
 
 
406 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.74 
 
 
404 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  63.17 
 
 
456 aa  525  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.71 
 
 
406 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.71 
 
 
406 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.66 
 
 
401 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.34 
 
 
398 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  58.77 
 
 
361 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  58.77 
 
 
361 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  58.5 
 
 
361 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  46.08 
 
 
399 aa  328  7e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  44.13 
 
 
384 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.22 
 
 
382 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  42.97 
 
 
382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.5 
 
 
384 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 
404 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.77 
 
 
399 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.22 
 
 
384 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.22 
 
 
384 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.46 
 
 
383 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  43.22 
 
 
384 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  42.68 
 
 
418 aa  286  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.46 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  39.65 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
383 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  39.03 
 
 
417 aa  275  8e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  38.78 
 
 
418 aa  272  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  35.31 
 
 
395 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.73 
 
 
382 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  39.66 
 
 
384 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  36.22 
 
 
388 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  36.39 
 
 
392 aa  209  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 
392 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 
382 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.77 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
343 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
325 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.17 
 
 
337 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
302 aa  66.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
314 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.17 
 
 
337 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
316 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.1 
 
 
320 aa  64.3  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
318 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
306 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
345 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 
336 aa  63.2  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  25.97 
 
 
329 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28493  predicted protein  24.08 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000203706  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  24.82 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.16 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33729  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000109637  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.53 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  32.67 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.49 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  23.51 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  23.55 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>