More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
382 aa  796    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.23 
 
 
382 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.87 
 
 
399 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  64.66 
 
 
399 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.61 
 
 
404 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.78 
 
 
384 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.78 
 
 
384 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.52 
 
 
384 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  60.1 
 
 
384 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  59.37 
 
 
390 aa  494  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.58 
 
 
384 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  59.33 
 
 
418 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.42 
 
 
383 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  59.84 
 
 
384 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.38 
 
 
383 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  56.1 
 
 
417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  55.84 
 
 
418 aa  444  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.87 
 
 
382 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  44.39 
 
 
395 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  42.34 
 
 
388 aa  336  5e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 
401 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  46.29 
 
 
406 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.38 
 
 
398 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  46.53 
 
 
401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  46.04 
 
 
402 aa  322  6e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  44.39 
 
 
386 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  43.81 
 
 
404 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
404 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.99 
 
 
406 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.3 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  45.52 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  43.85 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
406 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  41.04 
 
 
384 aa  310  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  43.73 
 
 
398 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.85 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.2 
 
 
398 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
406 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.22 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.97 
 
 
397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.73 
 
 
398 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  42.34 
 
 
456 aa  303  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  42.46 
 
 
397 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  43.22 
 
 
397 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40.66 
 
 
397 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.18 
 
 
397 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.18 
 
 
397 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.94 
 
 
389 aa  276  5e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  44.57 
 
 
361 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  44.57 
 
 
361 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  44.57 
 
 
361 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.49 
 
 
392 aa  265  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 
390 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  38.87 
 
 
392 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 
382 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.1 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5600  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.01 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  27.27 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.89 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
680 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  24.93 
 
 
323 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 
318 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
292 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
292 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
296 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  24.19 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
314 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2530  UDP-glucose 4-epimerase  33.86 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000741336 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  25.54 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  26.37 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  25.69 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  25.99 
 
 
316 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
315 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
315 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  25.23 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 
308 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  33.07 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
331 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
363 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1804  UDP-glucose 4-epimerase  29.8 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.89 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  24.76 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>