114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1303 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  100 
 
 
395 aa  825    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57 
 
 
382 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.51 
 
 
399 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.74 
 
 
404 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  48.21 
 
 
399 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 
382 aa  381  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  46.43 
 
 
384 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  44.39 
 
 
382 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  42.97 
 
 
390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
383 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  43.62 
 
 
384 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
384 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
384 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 
384 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.62 
 
 
383 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  42.38 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  42.38 
 
 
418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.6 
 
 
384 aa  332  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  40.55 
 
 
418 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  39.8 
 
 
388 aa  297  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  37.72 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  37.31 
 
 
401 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  37.63 
 
 
456 aa  266  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 
406 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  38.08 
 
 
406 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
406 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  37.02 
 
 
402 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  36.41 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.56 
 
 
398 aa  252  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
406 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.56 
 
 
406 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  37.66 
 
 
406 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 
404 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  36.86 
 
 
404 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  37.53 
 
 
391 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.66 
 
 
398 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  35.93 
 
 
386 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.31 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.31 
 
 
397 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.22 
 
 
397 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.4 
 
 
397 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.22 
 
 
397 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.14 
 
 
397 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
389 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.82 
 
 
398 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  34.45 
 
 
397 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 
392 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  38.35 
 
 
361 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  38.35 
 
 
361 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  38.07 
 
 
361 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
390 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  35.91 
 
 
392 aa  209  8e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
382 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.37 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  24.21 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.97 
 
 
311 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.77 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.45 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
316 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.06 
 
 
354 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
330 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
313 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
318 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0169  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  36.36 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.33 
 
 
680 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.93 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.56 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.77 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.87 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.96 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
772 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.84 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2064  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase (UDP-glucose 4-epimerase)  22.74 
 
 
327 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.97 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
332 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.84 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  20.77 
 
 
302 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>