More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_46754 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  100 
 
 
390 aa  821    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.14 
 
 
384 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.14 
 
 
384 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  64.57 
 
 
384 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.09 
 
 
384 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.91 
 
 
383 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.53 
 
 
383 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.84 
 
 
399 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  61.68 
 
 
399 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.96 
 
 
384 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.53 
 
 
382 aa  510  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  60.57 
 
 
418 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.79 
 
 
404 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  59.37 
 
 
382 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  54.43 
 
 
384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  53.25 
 
 
417 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  52.99 
 
 
418 aa  437  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.18 
 
 
382 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  42.97 
 
 
395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  41.62 
 
 
388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  42.04 
 
 
384 aa  327  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.89 
 
 
401 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  42.36 
 
 
406 aa  316  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.7 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.52 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  43.9 
 
 
406 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  44.88 
 
 
401 aa  309  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 
404 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.26 
 
 
406 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.27 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  42.34 
 
 
456 aa  304  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.01 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  40.74 
 
 
404 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  42.75 
 
 
391 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  42.56 
 
 
386 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  41.5 
 
 
398 aa  295  9e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  40.25 
 
 
402 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  41.31 
 
 
398 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 
389 aa  285  7e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  39.65 
 
 
397 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  39.65 
 
 
397 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40.81 
 
 
398 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  40 
 
 
397 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  38.48 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  38.48 
 
 
397 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  38.23 
 
 
397 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  39.29 
 
 
397 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  43.44 
 
 
361 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  43.15 
 
 
361 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  43.15 
 
 
361 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 
392 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  35.25 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
382 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
331 aa  63.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.32 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.25 
 
 
298 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.6 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 
680 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.56 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
372 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.34 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  24.57 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5568  UDP-glucose 4-epimerase  28.24 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
370 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
334 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.87 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
306 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.53 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.94 
 
 
368 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0816  UDP-glucose 4-epimerase  26.99 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.75 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.18 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
315 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5574  UDP-glucose 4-epimerase  27.65 
 
 
338 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739221  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  27.06 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 
772 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982206  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  30.23 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  30.23 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  24.74 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  22.42 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2824  UDP-galactose 4-epimerase  28.35 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>