More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1849 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
392 aa  810    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1116  UDP-sulfoquinovose synthase  54.92 
 
 
392 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0993953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 
390 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.4 
 
 
382 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.19 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1333  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.25 
 
 
382 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1240  UDP-sulfoquinovose synthase  42.39 
 
 
399 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.715585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33880  UDP-sulfoquinovose synthase  39.8 
 
 
384 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.454951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0393  UDP-sulfoquinovose synthase  39.33 
 
 
388 aa  270  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.955663  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26880  UDP-sulfoquinovose synthase  41.49 
 
 
382 aa  265  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.646966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 
384 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0639  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.4 
 
 
384 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.246431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.42 
 
 
384 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
382 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 
383 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1939  UDP-sulfoquinovose synthase  39.29 
 
 
418 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46754  predicted protein  37.21 
 
 
390 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0462  UDP-sulfoquinovose synthase  39.29 
 
 
417 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.604505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0293  UDP-sulfoquinovose synthase  37.97 
 
 
384 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0241  UDP-sulfoquinovose synthase  36.83 
 
 
384 aa  243  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.603555 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 
389 aa  239  5e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0521974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3746  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
384 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.016409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0398  UDP-sulfoquinovose synthase  35.33 
 
 
418 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1303  UDP-sulfoquinovose synthase  36.99 
 
 
395 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0578  UDP-sulfoquinovose synthase  37.46 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177862  normal  0.0605947 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108515  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.01 
 
 
406 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.409017  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21201  UDP-sulfoquinovose synthase, plastid precursor  35.13 
 
 
456 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.8 
 
 
397 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.33868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
404 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0049  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  34.41 
 
 
398 aa  209  9e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2569  UDP-sulfoquinovose synthase  35.69 
 
 
404 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.410099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2128  UDP-sulfoquinovose synthase  37.15 
 
 
406 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
406 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21351  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.52 
 
 
397 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00511  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.96 
 
 
398 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1509  UDP-sulfoquinovose synthase  36.44 
 
 
406 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1264  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.24 
 
 
397 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2097  UDP-sulfoquinovose synthase  36.34 
 
 
386 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0052  UDP-sulfoquinovose synthase  33.92 
 
 
398 aa  206  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.13 
 
 
398 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2598  UDP-sulfoquinovose synthase  35.77 
 
 
401 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.816239  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17921  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  36.97 
 
 
397 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.236777  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18741  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.39 
 
 
397 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.110238  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1757  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.39 
 
 
397 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18551  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  35.11 
 
 
397 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.733864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 
401 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0444  UDP-sulfoquinovose synthase  35.13 
 
 
391 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.52178  normal  0.455696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4947  UDP-sulfoquinovose synthase  36.02 
 
 
361 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4564  UDP-sulfoquinovose synthase  35.73 
 
 
361 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4652  UDP-sulfoquinovose synthase  35.73 
 
 
361 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
318 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  25.4 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  26.65 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
314 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.31 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.31 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  25.15 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.69 
 
 
336 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  25.38 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.15 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.15 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  25.15 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.15 
 
 
321 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.5 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 
332 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.377731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2948  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.564869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.44 
 
 
321 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
311 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
317 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  32.72 
 
 
329 aa  56.6  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.15 
 
 
321 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1063  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  23.17 
 
 
312 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  26.09 
 
 
340 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  26.09 
 
 
340 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.04 
 
 
311 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.05 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>